249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0283 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  96.28 
 
 		 188 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3648  Mammalian cell entry related domain protein  77.37 
 
 		 190 aa  303  7e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3806  Mammalian cell entry related domain protein  86.67 
 
 		 214 aa  298  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4358  hypothetical protein  82.1 
 
 		 183 aa  281  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52116  normal  0.0531845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0514  hypothetical protein  69.68 
 
 		 185 aa  273  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1144  hypothetical protein  69.68 
 
 		 185 aa  273  8e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0450  mce family protein  69.68 
 
 		 185 aa  273  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03058  predicted ABC-type organic solvent transporter  69.57 
 
 		 183 aa  254  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0514  Mammalian cell entry related domain protein  69.57 
 
 		 183 aa  254  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0145877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3489  Mce family protein  69.57 
 
 		 183 aa  254  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3681  Mce family protein  69.57 
 
 		 183 aa  254  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0116721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03009  hypothetical protein  69.57 
 
 		 183 aa  254  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0277207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4515  Mce family protein  69.57 
 
 		 183 aa  254  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0766033  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3386  Mce family protein  69.57 
 
 		 183 aa  254  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000578801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0507  hypothetical protein  69.57 
 
 		 183 aa  254  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.945849  normal  0.16691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3577  Mce family protein  69.57 
 
 		 183 aa  254  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3629  hypothetical protein  68.65 
 
 		 187 aa  253  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.271767  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3572  Mce family protein  67.74 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3503  Mce family protein  67.74 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3670  Mce family protein  67.74 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0296035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3501  Mce family protein  67.74 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0513461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3608  Mce family protein  67.74 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.345737 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1171  hypothetical protein  56.55 
 
 		 168 aa  198  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03656  hypothetical protein  56.25 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002411  uncharacterized ABC transporter, periplasmic component YrbD  56.33 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2885  hypothetical protein  51.32 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.827962  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  48.52 
 
 		 169 aa  161  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2100  hypothetical protein  55.7 
 
 		 163 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03184  mce family protein  51.57 
 
 		 157 aa  150  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  49.07 
 
 		 161 aa  148  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  47.24 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  44.72 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3079  mce-related protein  53.55 
 
 		 156 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  47.13 
 
 		 168 aa  144  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0723  hypothetical protein  54.72 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3952  mce-related protein  54.72 
 
 		 157 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0681  hypothetical protein  54.72 
 
 		 157 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.726556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3341  hypothetical protein  54.72 
 
 		 157 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.480692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  45.51 
 
 		 163 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  46.84 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  45.96 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3607  hypothetical protein  52.9 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0680  hypothetical protein  53.46 
 
 		 157 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.0968495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0559  hypothetical protein  53.29 
 
 		 154 aa  141  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0715  Mammalian cell entry related domain protein  53.46 
 
 		 157 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3660  hypothetical protein  53.46 
 
 		 157 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0108071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0724  hypothetical protein  53.46 
 
 		 157 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.150028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0694  hypothetical protein  53.46 
 
 		 157 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0735  virulence factor MCE-like protein  53.25 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.310055 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  47.95 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  45.86 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  41.53 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  47.37 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  41.34 
 
 		 175 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  44.87 
 
 		 153 aa  137  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  44.03 
 
 		 154 aa  137  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0498  hypothetical protein  51.97 
 
 		 157 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000028229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  43.98 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4231  hypothetical protein  51.95 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0707498  hitchhiker  0.000253037 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  46.71 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  44.94 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  43.98 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  48.05 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  48.05 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  42.6 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  44.94 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  46.71 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  47.06 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  46.71 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3368  hypothetical protein  50.66 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.150445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  44.3 
 
 		 181 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3302  hypothetical protein  53.95 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.132932 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0507  toluene tolerance protein Ttg2C  52.8 
 
 		 164 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4534  mce family protein  54.09 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.623769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  44.37 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  42.68 
 
 		 161 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  47.4 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  43.67 
 
 		 184 aa  131  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  42.68 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  48.47 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  46.1 
 
 		 155 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  43.04 
 
 		 156 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  42.24 
 
 		 156 aa  128  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  45.45 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2707  hypothetical protein  44 
 
 		 149 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0960  hypothetical protein  44.44 
 
 		 161 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  45.22 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  41.4 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  45.57 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0967  hypothetical protein  43.21 
 
 		 161 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  47.37 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.05 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3400  hypothetical protein  47.2 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  44.16 
 
 		 155 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4255  hypothetical protein  42.59 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0999  hypothetical protein  42.59 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.4 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.4 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>