More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0678 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
529 aa  1073    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2084  Mammalian cell entry related domain protein  28.32 
 
 
564 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  27.55 
 
 
523 aa  206  9e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1999  Mammalian cell entry related domain protein  28 
 
 
567 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1861  hypothetical protein  27.9 
 
 
567 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1978  hypothetical protein  25.73 
 
 
568 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308445  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  25.56 
 
 
515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  29.15 
 
 
529 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  29.91 
 
 
347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  25.5 
 
 
356 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  27.17 
 
 
349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  28.78 
 
 
332 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  25.63 
 
 
349 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  41.73 
 
 
150 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  43.48 
 
 
149 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  24.76 
 
 
356 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  43.26 
 
 
150 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  43.17 
 
 
150 aa  99.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  26.9 
 
 
355 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  23.73 
 
 
430 aa  92  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  36.23 
 
 
148 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  36.96 
 
 
164 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  24.32 
 
 
360 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  25.5 
 
 
321 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  38.41 
 
 
148 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  26.92 
 
 
359 aa  88.2  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  23.84 
 
 
333 aa  86.7  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  25.56 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  25 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  29.93 
 
 
152 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  24.7 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  34.53 
 
 
152 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  38.57 
 
 
150 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  37.23 
 
 
148 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  35.07 
 
 
149 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  33.82 
 
 
146 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0518  virulence factor Mce family protein  32.11 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09310  virulence factor Mce family protein  27.24 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.91288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  36.23 
 
 
148 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  24.93 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  23.31 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  23.83 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  34.78 
 
 
148 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.88 
 
 
360 aa  77  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  25.16 
 
 
332 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1169  virulence factor Mce family protein  25.4 
 
 
356 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  36.84 
 
 
173 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  24.84 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  35.21 
 
 
152 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  37.96 
 
 
151 aa  75.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0923  virulence factor Mce family protein  25.74 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  37.5 
 
 
156 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  38.06 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  34.31 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0364  virulence factor Mce family protein  24.92 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10171  MCE-family protein mce1B  25.41 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  34.78 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  23.9 
 
 
342 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  36.84 
 
 
161 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  33.58 
 
 
152 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  22.67 
 
 
314 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  33.58 
 
 
152 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  24.23 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  37.5 
 
 
155 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09330  virulence factor Mce family protein  24.5 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3949  virulence factor Mce family protein  26.29 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  37.5 
 
 
163 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  37.31 
 
 
184 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  37.31 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13531  MCE-family protein mce4C  25.99 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  24.87 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  36.09 
 
 
161 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  36.76 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  24.33 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0109  virulence factor Mce family protein  24.33 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  24.33 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4187  virulence factor Mce family protein  24.31 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.39714  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  25.08 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  24.24 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0517  virulence factor Mce family protein  24.08 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5200  virulence factor Mce family protein  24.83 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168356  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  35.33 
 
 
154 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  24.68 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2103  virulence factor Mce family protein  25.67 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.867723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2106  virulence factor Mce family protein  28.06 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.583314  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  34.06 
 
 
162 aa  68.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4398  virulence factor Mce family protein  24.66 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0135  virulence factor Mce family protein  24.92 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  36.69 
 
 
160 aa  68.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4997  virulence factor Mce family protein  24.2 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  34.72 
 
 
154 aa  67  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  26.32 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3670  virulence factor MCE-like protein  24.1 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3743  virulence factor Mce family protein  24.1 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1558  virulence factor Mce family protein  23.58 
 
 
352 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0924  virulence factor Mce family protein  25.1 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  33.57 
 
 
155 aa  67  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  31.62 
 
 
156 aa  67  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>