228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2448 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  23.84 
 
 		 529 aa  86.7  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  24.25 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  24.17 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  25.21 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  21.47 
 
 		 515 aa  79.3  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  23.15 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  26.89 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  26.84 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.7 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  22.14 
 
 		 523 aa  72  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  23.7 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  25.9 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  22.4 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  23.42 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  24.37 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  25.54 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  26.22 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  21.88 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  22.04 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  23.48 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  23.59 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  27.56 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  23.87 
 
 		 360 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  25.16 
 
 		 312 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  22.92 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  20.06 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  24.82 
 
 		 433 aa  65.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  24.82 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  22.7 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  25.68 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  27.15 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  25.12 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  20.82 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  23.31 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  24.05 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  24.53 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  20.85 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  24.76 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  26.76 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.23 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.23 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  24.63 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  20.45 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  24.9 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  22.67 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  31.31 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  23.81 
 
 		 312 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09330  virulence factor Mce family protein  27.71 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  25.93 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  29 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  21.77 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  19.94 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  23.39 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  32.5 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  22.53 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  20.5 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2984  virulence factor Mce family protein  24.19 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  19.1 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  25.17 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  23.02 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  20.27 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  21.45 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  27.97 
 
 		 148 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4535  virulence factor Mce family protein  24.57 
 
 		 487 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00220219  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  22.3 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1105  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.28 
 
 		 151 aa  55.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.165504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  30.6 
 
 		 148 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03770  virulence factor Mce family protein  22.12 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  28.89 
 
 		 178 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  37.37 
 
 		 196 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  23.46 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  29.51 
 
 		 186 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  21.18 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  21.92 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  21.74 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1888  Mammalian cell entry related domain protein  25.85 
 
 		 529 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  20.48 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  29.51 
 
 		 181 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  19.3 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  22.64 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13531  MCE-family protein mce4C  35.4 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5200  virulence factor Mce family protein  23.76 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168356  normal  0.194199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  22.26 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  22.74 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4147  virulence factor Mce family protein  21.69 
 
 		 507 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  26.63 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2513  virulence factor Mce family protein  24.12 
 
 		 564 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  22.91 
 
 		 456 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  21.15 
 
 		 316 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  26.67 
 
 		 149 aa  52.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  25.4 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2511  virulence factor Mce family protein  22.22 
 
 		 503 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  21.12 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  21.82 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  26.87 
 
 		 150 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  21.46 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  21.71 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  27.34 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>