150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0021 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  100 
 
 
313 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  26 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  24.37 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  23.86 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  26.87 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  24.25 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  21.09 
 
 
515 aa  63.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  29.31 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.88 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  23.4 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  27.73 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  24.75 
 
 
523 aa  60.8  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4616  virulence factor MCE-like protein  32.8 
 
 
344 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4704  virulence factor Mce family protein  32.8 
 
 
344 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112748  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  32.58 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  24.15 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  32.09 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  24.9 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  34.4 
 
 
148 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  20.14 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  26.43 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  24.12 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  24.35 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  25.56 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  25.56 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10601  MCE-family protein mce2B  31.1 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  30.66 
 
 
342 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  23.46 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  27.04 
 
 
456 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  24.29 
 
 
312 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  26.02 
 
 
307 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3825  virulence factor Mce family protein  26.64 
 
 
344 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  26.11 
 
 
312 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.51 
 
 
296 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.51 
 
 
296 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  23.28 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  24.71 
 
 
433 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.13 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  28.28 
 
 
579 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  34.51 
 
 
455 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  23.97 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  26.67 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  23.28 
 
 
360 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  25.26 
 
 
456 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  31.06 
 
 
346 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4999  virulence factor Mce family protein  33.65 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0351  putative ABC transport system substrate-binding protein  23.88 
 
 
377 aa  53.1  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03760  virulence factor Mce family protein  23.33 
 
 
398 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.704534  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  25.26 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  33.96 
 
 
313 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.75 
 
 
320 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  24.61 
 
 
312 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  33.64 
 
 
362 aa  52.8  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  24.61 
 
 
312 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.47 
 
 
309 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  25.4 
 
 
313 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  21.89 
 
 
301 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  30.63 
 
 
148 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5201  virulence factor Mce family protein  30.58 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.922675  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  32.73 
 
 
148 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  28 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  30.51 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  28.21 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4161  virulence factor Mce family protein  31.82 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  24.32 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2102  virulence factor Mce family protein  30.13 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0525635  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  21.4 
 
 
324 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  26.18 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  22.91 
 
 
529 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  26.18 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  23.3 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1557  virulence factor Mce family protein  35.19 
 
 
343 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10171  MCE-family protein mce1B  24.71 
 
 
346 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  32.76 
 
 
155 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  24.3 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  24.3 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  27.19 
 
 
306 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  24.3 
 
 
309 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  23.77 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  36.73 
 
 
158 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  24.54 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  22.96 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0501  virulence factor Mce family protein  30.71 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298085  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4398  virulence factor Mce family protein  30.47 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  22.41 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  24.03 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1655  virulence factor MCE-like protein  30.71 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2823  virulence factor Mce family protein  29.68 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1679  virulence factor Mce family protein  30.71 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.859349  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1628  virulence factor Mce family protein  30.71 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0651  virulence factor Mce family protein  30.71 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  27.18 
 
 
343 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  23.53 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  22.88 
 
 
330 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  29.37 
 
 
150 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  32.38 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  26.04 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13532  MCE-family protein mce4B  31.19 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717957 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>