202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2514 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  36.6 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  35.95 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  35.95 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  35.29 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  34.97 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  33.88 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  34.31 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  36.22 
 
 		 306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  33.99 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  35.16 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  34.52 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  34.84 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  33.45 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  33.11 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  32.37 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  37.31 
 
 		 359 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  37.31 
 
 		 359 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  34.96 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  37.33 
 
 		 433 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  34.59 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  31.37 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  34.59 
 
 		 360 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  33.44 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  34.1 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  34.13 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  32.19 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.87 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  33.59 
 
 		 579 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  31.5 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  31.25 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  32.71 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  32.23 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  33.45 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  33.9 
 
 		 317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  34.41 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  32.04 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  31.72 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  31.46 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  30.59 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  29.11 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  32.97 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.65 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  30.84 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  26.09 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.09 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.62 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  27.3 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  31.7 
 
 		 456 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  27.3 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  31.25 
 
 		 456 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  32.09 
 
 		 458 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  33.68 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  27.69 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  29.94 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  31.14 
 
 		 455 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.77 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  27.62 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  31.96 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  25.34 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  32.39 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  30.04 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  33.5 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  35.08 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.07 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.2 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.35 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  25.4 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  30.15 
 
 		 390 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  30.15 
 
 		 390 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  24.49 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  31.76 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  21.52 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  25.16 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  27.63 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  29.53 
 
 		 398 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  31 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0661  hypothetical protein  27.89 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  25.65 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  27.09 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  24.25 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  24.45 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  22.29 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  25.75 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  25.52 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  26.48 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  21.34 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  28.29 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  25.52 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  24.18 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  26.33 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  30.19 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  25.08 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  24.72 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  27.66 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.99 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  29.14 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  29.14 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  24.84 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>