177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4715 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  80.4 
 
 		 390 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 		 398 aa  797    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  78.2 
 
 		 390 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  71.54 
 
 		 367 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  63.71 
 
 		 369 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  60.43 
 
 		 367 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  40.74 
 
 		 378 aa  278  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  43.46 
 
 		 293 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  37.98 
 
 		 291 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  40.2 
 
 		 292 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  37.98 
 
 		 317 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  36.67 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  38.34 
 
 		 289 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  39.37 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  38.76 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  38.76 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  38.76 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  40 
 
 		 360 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  34.09 
 
 		 353 aa  123  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  38.42 
 
 		 359 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  37.44 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  37.67 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  32.34 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  31.84 
 
 		 456 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  34.65 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  36.06 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  31.55 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  34.38 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  31.84 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  35.94 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.27 
 
 		 331 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.36 
 
 		 331 aa  103  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  32.81 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  32.81 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  49.5 
 
 		 101 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  31.55 
 
 		 307 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  31 
 
 		 313 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  34.59 
 
 		 209 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  41.38 
 
 		 305 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  30.06 
 
 		 204 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  41.38 
 
 		 312 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 		 308 aa  93.2  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  41.38 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  31.58 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  43.1 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  43.1 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  31.58 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  33.77 
 
 		 200 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  32.83 
 
 		 312 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  39.66 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  31.58 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  39.66 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  33.94 
 
 		 198 aa  89.7  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  33.11 
 
 		 200 aa  89.7  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  31.55 
 
 		 192 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.2 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  29.65 
 
 		 313 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  44.35 
 
 		 313 aa  87  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  31.98 
 
 		 203 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  29.53 
 
 		 302 aa  86.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  34.4 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  34.4 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  40.52 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  28.37 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  32.77 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  40.52 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  33.91 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  27.88 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  31.09 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  30.99 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  31.33 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  43.1 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  25.88 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  36.28 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  43.3 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  34.19 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  33.08 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  37.61 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  29.3 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  33.93 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  37.61 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  37.17 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  40.52 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  31.03 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  26.96 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  36.84 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  35.65 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  29.29 
 
 		 579 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  26.28 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.17 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  26.23 
 
 		 211 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  24.17 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.77 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  28.17 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0661  hypothetical protein  27.17 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  23.41 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  34.92 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  28.14 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>