68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1912 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  100 
 
 
214 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  92.59 
 
 
214 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  56.76 
 
 
211 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  57.38 
 
 
207 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  55.79 
 
 
211 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  52.73 
 
 
247 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  54 
 
 
208 aa  205  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  55 
 
 
211 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  52.06 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  49.18 
 
 
199 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1609  hypothetical protein  42.42 
 
 
220 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  36.49 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  34.15 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  32.2 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  32.2 
 
 
213 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  38.5 
 
 
208 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.37 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  30.93 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  28.08 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  30.9 
 
 
247 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  29.52 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  32.52 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  29.3 
 
 
398 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  26.6 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  34.07 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  34.07 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  27.41 
 
 
378 aa  71.6  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  23.47 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  29.49 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  26.63 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  31.39 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  26.21 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  30.61 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  26.21 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  27.4 
 
 
390 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  26.58 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  27.63 
 
 
367 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  27.1 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  26.58 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  27.78 
 
 
198 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  26.71 
 
 
390 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  24.26 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.06 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  32.69 
 
 
367 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  30.34 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  30.84 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  30.84 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  30.84 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2745  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.94 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.13119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  25.4 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  22.17 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  29.3 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  25.49 
 
 
369 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  26.87 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  26.87 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  26.87 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  26.87 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  26.87 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2009  putative lipoprotein  21.53 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  26.37 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1640  putative lipoprotein  21.53 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  26.37 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0745  hypothetical protein  27.35 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1220  hypothetical protein  27.35 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0478  hypothetical protein  31.11 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159106  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  27.97 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1821  putative lipoprotein  21.53 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  26.11 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>