66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2001 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  414  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  36.62 
 
 
205 aa  104  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  33.16 
 
 
199 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.34 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  32.61 
 
 
217 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  31.22 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  27.69 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  27.69 
 
 
213 aa  85.1  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  30.11 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  30.69 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  30.93 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  30.22 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  31.98 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  32.64 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  33.33 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.17 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  32.96 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  30.27 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  32.96 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  25.79 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  32.37 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  32.16 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  27.05 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  31.79 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  27.04 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  30.26 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  31.94 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  26.23 
 
 
398 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  27.74 
 
 
390 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  25.86 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  28.19 
 
 
192 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  27.98 
 
 
378 aa  61.6  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  29.41 
 
 
367 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  27.8 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  24.82 
 
 
390 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  25 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  25 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  28.08 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  31.62 
 
 
369 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  26.49 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  25.62 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  30.14 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  28.08 
 
 
198 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2745  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  24.49 
 
 
195 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.13119 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  41.18 
 
 
101 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  29.06 
 
 
367 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1609  hypothetical protein  27.59 
 
 
220 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.43 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0478  hypothetical protein  38.18 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159106  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2022  hypothetical protein  25.18 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2027  hypothetical protein  24.46 
 
 
200 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  32.11 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  32.11 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  32.11 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  29.52 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  27.6 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  27.5 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  28 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  29.52 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  30.5 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  29.52 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  29.52 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  29.52 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  30.83 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.63 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2842  hypothetical protein  27.03 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>