26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3567 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  431  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  32.16 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.08 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  26.83 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  26.97 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  26.4 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  26.72 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  26.72 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  24.65 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  25.65 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  26.32 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  28.69 
 
 
213 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  29.79 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  24.65 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  29.08 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  30.81 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  21.81 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  25.4 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  26.94 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  26.42 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  25.76 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  31.62 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  31.62 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  22.95 
 
 
378 aa  45.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  24.43 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.1 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>