75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0576 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  100 
 
 
213 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  99.53 
 
 
213 aa  437  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  61.27 
 
 
211 aa  278  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  52.02 
 
 
213 aa  223  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  33.86 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  32.2 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  33.11 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  32.83 
 
 
205 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  32.89 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  29.06 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  30.27 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  27.62 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  28.85 
 
 
211 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  26.34 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  27.69 
 
 
209 aa  85.5  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  29.57 
 
 
213 aa  84.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  27.45 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  29.05 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  26.6 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  27.45 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  27.45 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  28.87 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  28.74 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  26.47 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  23.83 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  26.09 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  25.71 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  27.7 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  26.72 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  29.32 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  28.72 
 
 
367 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  25.34 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  26.71 
 
 
192 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1609  hypothetical protein  25.13 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  26.6 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  24.32 
 
 
390 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  26.15 
 
 
201 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  25.47 
 
 
369 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  26.15 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  25.97 
 
 
398 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  23.3 
 
 
367 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  27.7 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  28.15 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  27.83 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  26.24 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  26.03 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  27.83 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2027  hypothetical protein  26.71 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2009  putative lipoprotein  21.92 
 
 
199 aa  48.5  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  27.83 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  25 
 
 
390 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1821  putative lipoprotein  22.6 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  23.65 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  25.68 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1640  putative lipoprotein  22.6 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  26.35 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  26.35 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  26.35 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  26.35 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2022  hypothetical protein  26.09 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  26.35 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  26.35 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  23.49 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  24.32 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  27.45 
 
 
101 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  24 
 
 
198 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  26.83 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  26.35 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  25.68 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  25 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  24.85 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  24.7 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  24.85 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  22.75 
 
 
199 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  24.35 
 
 
207 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>