53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6240 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  100 
 
 
207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  87.92 
 
 
238 aa  343  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  86.47 
 
 
207 aa  333  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  93.24 
 
 
221 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  93.24 
 
 
207 aa  330  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  93.24 
 
 
207 aa  330  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  88.41 
 
 
207 aa  324  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  72.06 
 
 
212 aa  294  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  71.57 
 
 
212 aa  291  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  71.57 
 
 
212 aa  291  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  71.57 
 
 
212 aa  291  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  71.57 
 
 
212 aa  291  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  71.08 
 
 
212 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  75.41 
 
 
210 aa  289  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  70.59 
 
 
212 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  68.63 
 
 
208 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  66.01 
 
 
208 aa  261  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  69.14 
 
 
208 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  41.62 
 
 
208 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  43.21 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  43.21 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  39.63 
 
 
211 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  42.41 
 
 
228 aa  104  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  41.83 
 
 
217 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  37.71 
 
 
215 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  34.38 
 
 
234 aa  99  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  34.27 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  43.71 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  39.55 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  41.71 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  39.42 
 
 
225 aa  89.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  36.69 
 
 
172 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  39.7 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  34.78 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  32.28 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  32.28 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  35.15 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  32.16 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  31.96 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  25.54 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  24.49 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  29.47 
 
 
211 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  24.32 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  24.32 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  26.96 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  29.13 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  26.92 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  27.97 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1361  hypothetical protein  31.93 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  27.43 
 
 
198 aa  42  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  26.5 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1202  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.24 
 
 
208 aa  41.6  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.203134  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  26.84 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>