43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0040 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  66.49 
 
 
211 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  64.36 
 
 
211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  67.03 
 
 
207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  63.39 
 
 
211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  54 
 
 
214 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  54.4 
 
 
214 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  48.65 
 
 
199 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  44.95 
 
 
205 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  42.99 
 
 
247 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1609  hypothetical protein  39.59 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  32.82 
 
 
213 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  36.07 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  27.45 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  27.45 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  25 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  30.27 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.94 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  28.79 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  27.72 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  26.6 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  32.2 
 
 
201 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  25.56 
 
 
247 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  31.36 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.27 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  26.19 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  23.96 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  24.71 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  25.71 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  22.4 
 
 
209 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  25.85 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  21.31 
 
 
398 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  27.92 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  26.67 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  27.32 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  30.08 
 
 
367 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  23.53 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  26.67 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  26.67 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  26.67 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  26.67 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  29.46 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  26.67 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>