57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0434 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  100 
 
 
212 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  99.53 
 
 
212 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  98.58 
 
 
212 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  98.11 
 
 
212 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  98.11 
 
 
212 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  98.11 
 
 
212 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  98.11 
 
 
212 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  88.57 
 
 
210 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  71.77 
 
 
238 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  75.42 
 
 
207 aa  279  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  69.71 
 
 
208 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  72.06 
 
 
207 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  68.75 
 
 
208 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  75.98 
 
 
221 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  75.98 
 
 
207 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  75.98 
 
 
207 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  72.55 
 
 
207 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  67.4 
 
 
208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  40.22 
 
 
208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  41.38 
 
 
221 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  41.38 
 
 
221 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  40 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  36.17 
 
 
215 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  40.31 
 
 
228 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  37.68 
 
 
234 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  38.67 
 
 
211 aa  99  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  33.33 
 
 
237 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  39.57 
 
 
172 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  35.68 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  35.68 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  37.82 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  39 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  38.5 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  39.07 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  39.3 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  35.98 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  31.41 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  26.63 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  25.95 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  32.37 
 
 
234 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  30.43 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  28.46 
 
 
247 aa  48.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0250  putative lipoprotein  32 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  27.92 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  24.24 
 
 
204 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  26.35 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  26.35 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  26.37 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  27.54 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  27.5 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1361  hypothetical protein  28.14 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  26.64 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1202  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.24 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.203134  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.25 
 
 
220 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  26.02 
 
 
200 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0478  hypothetical protein  27.89 
 
 
199 aa  41.6  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  28.91 
 
 
211 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.646492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>