30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1032 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 101 aa  208  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  79 
 
 		 369 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  56 
 
 		 367 aa  116  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  57.58 
 
 		 367 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  51.43 
 
 		 390 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  49.5 
 
 		 398 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  46.15 
 
 		 390 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  37 
 
 		 378 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  35 
 
 		 213 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  32.32 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  34.34 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  35 
 
 		 198 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  30 
 
 		 207 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  28.89 
 
 		 207 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  41.18 
 
 		 209 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  28.3 
 
 		 209 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  28.89 
 
 		 207 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  29.41 
 
 		 213 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  28.28 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  27.45 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  27.45 
 
 		 213 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  30.61 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  35.42 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  35.42 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  24.76 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  33.01 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>