55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4116 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  38.33 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  37.22 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  37.22 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  39.9 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  38.54 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  38.42 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  40.78 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  36.93 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  40.93 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  38.42 
 
 		 192 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  40.8 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  32.6 
 
 		 378 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  42.42 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  41.07 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  40.85 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  40.85 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  29.57 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 398 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  34.76 
 
 		 390 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  30.96 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  34.18 
 
 		 367 aa  91.7  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  31.51 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  32.12 
 
 		 367 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  32.76 
 
 		 247 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  30.73 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  31.29 
 
 		 390 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  29.57 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  29.57 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  31.79 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.9 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  28.66 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  33.51 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  32.97 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  27.78 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  31.69 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  23.47 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  25.79 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  26.8 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  27.03 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  23.78 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  29.86 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  27.88 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  35 
 
 		 101 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.86 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  25.43 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.78 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  23.28 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  23.96 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  31.25 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  32.58 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  29.23 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  24.08 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  30.83 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>