37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1194 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  100 
 
 
202 aa  411  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  31.64 
 
 
199 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  32.07 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  28.72 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  28.08 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  29.61 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  31.33 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  30.2 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.02 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  26.34 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  25.86 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  30.32 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1609  hypothetical protein  25.53 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  27.72 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.93 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  26.37 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  27.13 
 
 
247 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  30.71 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  27.37 
 
 
228 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  25.81 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  23.65 
 
 
213 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  30.83 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  30.08 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  23.78 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  24.26 
 
 
208 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  28.65 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  23.28 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.98 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  25.13 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  23.08 
 
 
192 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.4 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  20.86 
 
 
378 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  23.74 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  23.37 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  21.2 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2911  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  26.6 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  20 
 
 
390 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>