52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1717 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  100 
 
 		 201 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  85.41 
 
 		 201 aa  309  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  85.95 
 
 		 201 aa  309  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  41.8 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  36.81 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  36.02 
 
 		 247 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  35.08 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  29.65 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  29.5 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  30.27 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  30.26 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  32.52 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  27.46 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  28.64 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  30.2 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  29.89 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.13 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  32.66 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  32 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.45 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  33.57 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  32.77 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  30.89 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  27.78 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  27.46 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  27.46 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  29.71 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  25.34 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  25.34 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  31.09 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  29.27 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  32.69 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  32.69 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  32.5 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  28.8 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  26.7 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  30.56 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  30.91 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  31.88 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  30.34 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  32.77 
 
 		 390 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2027  hypothetical protein  26.63 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  26.19 
 
 		 369 aa  44.7  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  28.1 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  24.29 
 
 		 398 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2022  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  29.1 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1220  hypothetical protein  26.75 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0745  hypothetical protein  26.75 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  31.09 
 
 		 390 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>