40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2345 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  38.8 
 
 		 247 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  31.53 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  26.8 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  24.24 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  23.44 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  25.13 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  30.15 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  27.32 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  24.35 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  23.84 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  26.88 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  28.03 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  25 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  26.49 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  27.73 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  28.32 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  24.37 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  20.5 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  26.54 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  28.44 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  25.13 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  28.78 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  22.17 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  20.3 
 
 		 398 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  23.35 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  25.32 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  24.15 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  16.88 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  23.65 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  23.65 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  27.43 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  21.47 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  26.83 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  25.71 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  16.88 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  20.83 
 
 		 390 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  21.53 
 
 		 390 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  23.74 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>