50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2110 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  78.5 
 
 
200 aa  332  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  78 
 
 
200 aa  330  9e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  50.75 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  49.25 
 
 
203 aa  194  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  45.95 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  46.46 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  43.07 
 
 
228 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  38.33 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  34.66 
 
 
192 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  37.43 
 
 
198 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  32.6 
 
 
378 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  35.84 
 
 
198 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  35.15 
 
 
390 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  36.59 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  34.59 
 
 
398 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  31.09 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  34.64 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  33.92 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  33.14 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  32.61 
 
 
367 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  32.34 
 
 
207 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  32.68 
 
 
367 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  32.34 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  28.87 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  28.87 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  25.62 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  25 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  29.21 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.36 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  27.68 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  28.08 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  33.15 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  25.44 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  29.89 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  29.35 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  25.29 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  25.86 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  24.26 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  23.56 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  22.22 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  22.99 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  21.97 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  20.5 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  22.4 
 
 
208 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  28.3 
 
 
101 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  21.51 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  27.7 
 
 
208 aa  45.1  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  21.2 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>