62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03180 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  61.27 
 
 		 213 aa  278  5e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  61.27 
 
 		 213 aa  278  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  58.17 
 
 		 213 aa  255  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  35.94 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  34.15 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  34.73 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  33.5 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  35.57 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  28.65 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.19 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  30.85 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  33.33 
 
 		 378 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  29.73 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  31.51 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  31.76 
 
 		 203 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  31.76 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  31.09 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  28.57 
 
 		 228 aa  88.2  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  29.85 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  29.85 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  29.63 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  25 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1609  hypothetical protein  29.7 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  27.69 
 
 		 390 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  31.76 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  26.67 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.84 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  26.23 
 
 		 398 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  27.32 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  27.05 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  26.77 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  29.45 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  26.2 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  28.46 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  28.46 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  25.14 
 
 		 367 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  26.32 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  25.25 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  27.7 
 
 		 369 aa  58.2  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  28.48 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  28.48 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  28.76 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  27.66 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  27.13 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  28.48 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  25 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  24.87 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  26.67 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  26.9 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.74 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2027  hypothetical protein  24.81 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  25.26 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2022  hypothetical protein  24.06 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  28.74 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  23.37 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.5 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2009  putative lipoprotein  18.46 
 
 		 199 aa  42  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1640  putative lipoprotein  18.97 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>