167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1355 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  87.21 
 
 		 390 aa  685    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  782    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  80.4 
 
 		 398 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  70.46 
 
 		 367 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  62.43 
 
 		 369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  60.43 
 
 		 367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  39.68 
 
 		 378 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  44.5 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  37.62 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  37.98 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  39.3 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  36.67 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  37.82 
 
 		 289 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  39.09 
 
 		 307 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  37.8 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  37.8 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  37.8 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  40.74 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  37.93 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  37.44 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  31.93 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  35.35 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  30.84 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  32.26 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  30.4 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  35.29 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  33.82 
 
 		 455 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  51.43 
 
 		 101 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  32.81 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  32.81 
 
 		 308 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  35.1 
 
 		 306 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  31.75 
 
 		 307 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  36.46 
 
 		 331 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  33.65 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  33.33 
 
 		 209 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  41.38 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.36 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  30.15 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  31.96 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  34.34 
 
 		 312 aa  90.1  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  31.96 
 
 		 312 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  36.46 
 
 		 308 aa  89.7  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  43.1 
 
 		 321 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  43.1 
 
 		 321 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  40.52 
 
 		 312 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  30.88 
 
 		 312 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  33.11 
 
 		 200 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  28.5 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  31.96 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  43.1 
 
 		 321 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  31.29 
 
 		 213 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  32.45 
 
 		 200 aa  86.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.21 
 
 		 296 aa  86.3  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  33.85 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  30.65 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.4 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.4 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  33.91 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  38.79 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  38.79 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  32.1 
 
 		 198 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  28.24 
 
 		 204 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  43.48 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  26.92 
 
 		 307 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  46.39 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  26.44 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  37.61 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  32 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  43.97 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  31.22 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  32 
 
 		 204 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  26.67 
 
 		 192 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  31.43 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  24.55 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  26.03 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  24.76 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.61 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  30.58 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  30.17 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  29.56 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  31.25 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  36.36 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  36.36 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  36.67 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  36.67 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  36.67 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  35.09 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  35.54 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  28.67 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.09 
 
 		 275 aa  67  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  28.5 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.55 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  28.98 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  29.55 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  29.94 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  24.39 
 
 		 199 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0661  hypothetical protein  26.63 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  27.4 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  34.48 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>