58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2192 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  100 
 
 		 203 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  92.61 
 
 		 203 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  59.89 
 
 		 204 aa  224  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  50.75 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  54.14 
 
 		 204 aa  197  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  46.73 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  46.23 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  42.36 
 
 		 228 aa  148  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  34.29 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  36.93 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  40.1 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  34.62 
 
 		 378 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  35.67 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  36.42 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  41.3 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  33.33 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  31.87 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  34.07 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  32.09 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  31.76 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  32.77 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  29.05 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  29.05 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  32.34 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  31.64 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  32.28 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  30 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.64 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  29.67 
 
 		 369 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  32 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  29.22 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.58 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  31.49 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  30.94 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  25.85 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  25.29 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  26.21 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  25.58 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  25.13 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  27.8 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  25 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  26.37 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  26.84 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  21.67 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  23.78 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  20.96 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  24.46 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  22.41 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  22.41 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  24.73 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  26.67 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  27.16 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2009  putative lipoprotein  26.37 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1640  putative lipoprotein  27.87 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  35.42 
 
 		 101 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1821  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  26.64 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>