56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04750 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  53.8 
 
 		 199 aa  201  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  52.06 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  48.37 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  51.93 
 
 		 214 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  48.13 
 
 		 207 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  48.11 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  47.34 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  47.54 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  44.95 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1609  hypothetical protein  37.89 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  41.21 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  32.83 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  32.83 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  36.62 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  34.36 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  33.5 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.47 
 
 		 228 aa  90.5  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  32.07 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  28.8 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  27.68 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  28.65 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  27.08 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  27.03 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  32.29 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  25.29 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.5 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  29.1 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  29.1 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  28.78 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  34.81 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  28.35 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  26.84 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  23.87 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  25.34 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  27.88 
 
 		 367 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  30.67 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  26.42 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  26.88 
 
 		 390 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  25.25 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  23.86 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  22.22 
 
 		 398 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  27.15 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  27.85 
 
 		 369 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  25.5 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.38 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.46 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0745  hypothetical protein  24.07 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1220  hypothetical protein  24.07 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  29.75 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  29.1 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2745  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.44 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.13119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  28.15 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  28.15 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  29.41 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  33.01 
 
 		 101 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>