61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3671 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  48.85 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  43.93 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  40.78 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  44.97 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  40.66 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  40.1 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  48.47 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  41.12 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  37 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  37.43 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  36.5 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  31.34 
 
 		 378 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  41.72 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  41.88 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  41.88 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  35.53 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  36.81 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  35.8 
 
 		 390 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  33.94 
 
 		 398 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  33.16 
 
 		 367 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  35.37 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  32.1 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  31.94 
 
 		 369 aa  81.3  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  35.62 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  32.42 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.89 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  29.45 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  29.32 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  32.06 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  29.32 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  30.89 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  31.3 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  30.94 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  29.17 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  30 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  30.67 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  26.21 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  27.78 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  28.08 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  28.03 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  28.65 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  25.52 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1032  ABC transporter substrate-binding protein  35 
 
 		 101 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  26.21 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  25.52 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0478  hypothetical protein  27.74 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2745  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  24.11 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.13119 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  30.12 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2009  putative lipoprotein  24.32 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1640  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2842  hypothetical protein  26.06 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1821  putative lipoprotein  26.79 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  29.86 
 
 		 207 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  26.53 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>