41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1678 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  25.67 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0465  protein of unknown function DUF330  26.29 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  27.54 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  26.47 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  30.25 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2911  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  24.42 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522786  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  28.46 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  27.85 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  29.17 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  27.98 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  23.35 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0120  conserved hypothetical lipoprotein  24.85 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  29.14 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  25.26 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  23.46 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  28.46 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  29.63 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  29.63 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2745  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.48 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.13119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  24.17 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  25.41 
 
 		 228 aa  44.7  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  22.16 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1220  hypothetical protein  27.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0745  hypothetical protein  27.41 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  26.12 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  27.78 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  27.78 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  25.83 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0250  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  24.08 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  22.45 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  26.02 
 
 		 212 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  31.5 
 
 		 227 aa  42  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  26.12 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  25.45 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1640  putative lipoprotein  22.37 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>