48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2283 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  100 
 
 
207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  100 
 
 
207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  100 
 
 
221 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  93.24 
 
 
207 aa  349  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  88.41 
 
 
238 aa  346  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  89.37 
 
 
207 aa  342  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  88.89 
 
 
207 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  74 
 
 
212 aa  295  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  73.5 
 
 
212 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  73.5 
 
 
212 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  73.5 
 
 
212 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  73.5 
 
 
212 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  77.05 
 
 
210 aa  291  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  72.06 
 
 
212 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  72.5 
 
 
212 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  70.1 
 
 
208 aa  269  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  68.14 
 
 
208 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  71.43 
 
 
208 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  41.04 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  42.86 
 
 
221 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  42.86 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  39.75 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  42.41 
 
 
228 aa  104  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  41.61 
 
 
217 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  37.02 
 
 
215 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  33.5 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  34.08 
 
 
234 aa  95.5  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  45.03 
 
 
227 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  36.72 
 
 
220 aa  88.2  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  38.85 
 
 
172 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  40.64 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  37.98 
 
 
225 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  39 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  32.07 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  32.07 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  31.49 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  32.66 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  34.34 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  32.92 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  26.63 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  23.86 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  24.74 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  24.74 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  27.45 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  28.43 
 
 
211 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1202  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  30.12 
 
 
208 aa  45.1  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.203134  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  27.18 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1361  hypothetical protein  31.09 
 
 
218 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>