43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4222 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  92.31 
 
 
208 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  69.71 
 
 
212 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  69.71 
 
 
212 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  69.71 
 
 
212 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  69.71 
 
 
212 aa  279  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  69.71 
 
 
212 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  69.23 
 
 
212 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  68.75 
 
 
212 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  72.93 
 
 
210 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  74.04 
 
 
208 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  70.62 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  67.32 
 
 
238 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  66.67 
 
 
207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  71.75 
 
 
221 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  71.75 
 
 
207 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  71.75 
 
 
207 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  65.69 
 
 
207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  45.66 
 
 
208 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  42.53 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  42.53 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  41.01 
 
 
211 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  37.12 
 
 
234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  34.38 
 
 
237 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  36.9 
 
 
215 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  37.7 
 
 
228 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  38.51 
 
 
217 aa  101  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  44.09 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  38.2 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  38.01 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  38.85 
 
 
172 aa  88.6  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  34.68 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  40.4 
 
 
222 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  32.11 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  34.59 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  34.59 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  29.33 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  31.68 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  29.65 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  25.54 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1202  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.66 
 
 
208 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.203134  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  25.27 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>