44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0247 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  100 
 
 
224 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  94.64 
 
 
225 aa  381  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  64.47 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  47.62 
 
 
237 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  49.78 
 
 
228 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  49.35 
 
 
234 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  49.75 
 
 
222 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  47.53 
 
 
234 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  43.68 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  38.69 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  38.19 
 
 
208 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  40.68 
 
 
207 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  39.7 
 
 
212 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  39.7 
 
 
212 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  39.7 
 
 
212 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  40 
 
 
212 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  39.7 
 
 
212 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  39.5 
 
 
212 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  39 
 
 
212 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  41.11 
 
 
210 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  37.97 
 
 
217 aa  92  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  35.05 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.8 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  38.42 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  36.65 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  36.65 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  44.29 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.89 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.89 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  39.89 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  38.89 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  36.72 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  37.5 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  30.19 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  31.98 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  31.98 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  32.04 
 
 
172 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  27.57 
 
 
198 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  29 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  23.81 
 
 
198 aa  55.8  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.54 
 
 
200 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  27.01 
 
 
198 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  32.06 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  27.36 
 
 
209 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>