44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0253 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  94.64 
 
 		 224 aa  381  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  64.97 
 
 		 220 aa  221  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  48.33 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  52.82 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  50 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  49.5 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  49.78 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  43.68 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  38.78 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  38.27 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  40.78 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  39.5 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  39.5 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  39.5 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  39.5 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  39.5 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  41.11 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  39 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  38.5 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  37.97 
 
 		 217 aa  91.7  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  35.42 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.3 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  38.98 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  43.17 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  40.22 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  40.11 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  40.11 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  36.65 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  36.65 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  37.99 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  38.04 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  36.72 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  31.25 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  32.49 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  32.49 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  30.1 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  28.17 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  32.14 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  23.92 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.54 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  27.01 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  32.06 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  27.36 
 
 		 209 aa  42  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>