42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0233 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  69.95 
 
 
234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  53.78 
 
 
234 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  52.31 
 
 
220 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  48.33 
 
 
225 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  52.33 
 
 
228 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  47.62 
 
 
224 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  52.08 
 
 
227 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  47.98 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  36.27 
 
 
217 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  34.38 
 
 
208 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  39.89 
 
 
201 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  39.13 
 
 
211 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  34.38 
 
 
210 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  37.24 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  33.85 
 
 
212 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  37.5 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  34.9 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  34.9 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  34.38 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  34.9 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  34.9 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  33.33 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  30.88 
 
 
215 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  34.27 
 
 
207 aa  95.1  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  33.51 
 
 
208 aa  91.7  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  36.52 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  37.08 
 
 
207 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.67 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.83 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  36.81 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  34.83 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  34.83 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  35.62 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  35.62 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  27.96 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  29.13 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  28.06 
 
 
198 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  29.38 
 
 
198 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  23.57 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  25.98 
 
 
200 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>