44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0316 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  100 
 
 		 211 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  76.44 
 
 		 221 aa  298  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  78.06 
 
 		 221 aa  288  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  50.81 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  49.21 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  43.58 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  40.93 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  39.11 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  40.93 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  38.95 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  39.59 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  38.95 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  38.95 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  38.95 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  38.62 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  38.42 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  39.63 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  38.07 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  37.89 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.6 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  40.85 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  40.85 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.75 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.75 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  39.75 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  40.41 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  38.02 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  33.99 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  39.64 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  37.11 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  37.95 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  35.23 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  40.88 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  38.1 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  36.75 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  35.27 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  30.72 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  30.72 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  31.28 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  30.41 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  26.37 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  29.76 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  29.08 
 
 		 207 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  26.12 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>