41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0069 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  62.37 
 
 
208 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  49.73 
 
 
211 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  49.46 
 
 
221 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  48.5 
 
 
221 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  35.53 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  35.53 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  36.7 
 
 
212 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  36.51 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  36.51 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  36.51 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  36.51 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  36.51 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  36.17 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  37.93 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  35.1 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  37.95 
 
 
207 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  35.8 
 
 
210 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  34.43 
 
 
234 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  37.7 
 
 
238 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  35.03 
 
 
217 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  37.78 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  35.79 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  35.79 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  35.79 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  33 
 
 
201 aa  95.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  38.95 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  36.36 
 
 
220 aa  88.2  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  34.03 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  32.6 
 
 
172 aa  82  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  37.42 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  35.71 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  33.69 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  31.78 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  32.61 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  31.38 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  30 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  29.79 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  25.89 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  26.39 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>