30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1525 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  25.95 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  25.95 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  29.84 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  25.54 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  25.54 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  25.95 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  25.54 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  25.54 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  26.22 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  26.28 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  26.63 
 
 
198 aa  58.5  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1202  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  20.28 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.203134  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  27.5 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2009  putative lipoprotein  25 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  25.2 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  23.48 
 
 
228 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1640  putative lipoprotein  24.49 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  23.57 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  25.93 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  23.58 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0745  hypothetical protein  21.8 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1220  hypothetical protein  21.8 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1821  putative lipoprotein  23.98 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  22 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  25 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  20.28 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  19.58 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  22.45 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>