47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0923 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  100 
 
 
228 aa  453  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  52.02 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  55.15 
 
 
220 aa  185  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  51.33 
 
 
225 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  51.79 
 
 
224 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  47.84 
 
 
234 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  52.5 
 
 
222 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  45.54 
 
 
234 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  39.8 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  40.31 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  45.31 
 
 
227 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  40.59 
 
 
210 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  44.56 
 
 
207 aa  121  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  41.45 
 
 
212 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  40.93 
 
 
212 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  40.93 
 
 
212 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  40.93 
 
 
212 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  40.93 
 
 
212 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  40.93 
 
 
212 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  40.93 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  38.17 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  43.2 
 
 
207 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  41.15 
 
 
221 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  41.15 
 
 
221 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  44.13 
 
 
238 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  44.69 
 
 
207 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  43.52 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  43.52 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  43.52 
 
 
221 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  40 
 
 
211 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  35.59 
 
 
208 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  38.33 
 
 
201 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  39.33 
 
 
208 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  29.65 
 
 
172 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  27.94 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  31.75 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  31.75 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  27.67 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  30.43 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  27.34 
 
 
198 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  26.5 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  21.05 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  25.84 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0250  putative lipoprotein  31.31 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  22.56 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  22.56 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>