51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0615 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  99.53 
 
 
212 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  99.06 
 
 
212 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  98.58 
 
 
212 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  98.58 
 
 
212 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  98.58 
 
 
212 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  98.58 
 
 
212 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  89.05 
 
 
210 aa  357  7e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  72.25 
 
 
238 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  75.98 
 
 
207 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  72.55 
 
 
207 aa  277  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  69.23 
 
 
208 aa  278  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  70.19 
 
 
208 aa  277  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  76.54 
 
 
221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  73.04 
 
 
207 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  76.54 
 
 
207 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  76.54 
 
 
207 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  67.96 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  40.78 
 
 
208 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  41.95 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  41.95 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  40.5 
 
 
217 aa  111  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  36.7 
 
 
215 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  38.16 
 
 
234 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  40.84 
 
 
228 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  39.23 
 
 
211 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  33.85 
 
 
237 aa  98.2  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  40.29 
 
 
172 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  36.22 
 
 
221 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  36.22 
 
 
221 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  38.34 
 
 
220 aa  88.2  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  39.5 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  39 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  39.74 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  39.8 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  31.94 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  35.98 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  26.09 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  33.49 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  25.95 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  31.06 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0250  putative lipoprotein  32 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  28.46 
 
 
247 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  26.35 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  26.35 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  26.67 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  24.24 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1361  hypothetical protein  28.14 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  26.37 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  29.52 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  27.54 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>