39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1793 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  100 
 
 
221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  35.9 
 
 
212 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  35.38 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  35.38 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  35.38 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  35.38 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  35.38 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  35.38 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  37.43 
 
 
210 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  36.55 
 
 
208 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  36.04 
 
 
208 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  32.28 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  35.03 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  29.86 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  35.22 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  31.21 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  35.62 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  35.25 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  31.71 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  31.58 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.58 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  31.58 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  31.48 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  30.72 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  30.66 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  29.29 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  28 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  36.84 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  31.54 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  33.73 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  32.21 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  32.37 
 
 
224 aa  52  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  31.97 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  30.99 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  26.13 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  26.57 
 
 
172 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  32.89 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  24.69 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>