48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2809 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  100 
 
 
207 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  98.07 
 
 
238 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  88.41 
 
 
207 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  86.47 
 
 
207 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  88.89 
 
 
221 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  88.89 
 
 
207 aa  318  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  88.89 
 
 
207 aa  318  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  75 
 
 
212 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  74.5 
 
 
212 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  74.5 
 
 
212 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  74.5 
 
 
212 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  74.5 
 
 
212 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  78.14 
 
 
210 aa  297  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  74 
 
 
212 aa  297  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  73.5 
 
 
212 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  69.27 
 
 
208 aa  271  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  68.78 
 
 
208 aa  268  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  73.71 
 
 
208 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  43.35 
 
 
208 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  44.44 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  44.44 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  40.85 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  37.63 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  42.7 
 
 
228 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  37.08 
 
 
237 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  40.94 
 
 
217 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  33.18 
 
 
234 aa  99.4  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  43.05 
 
 
227 aa  91.7  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  37.41 
 
 
172 aa  85.5  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  39.57 
 
 
222 aa  85.1  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  36.16 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  34.24 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  34.24 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  32.2 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  37.19 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  36.36 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  35.58 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  32.16 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  34.72 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  25.54 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  22.56 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  23.96 
 
 
213 aa  52  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  23.96 
 
 
213 aa  52  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1202  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  30.56 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.203134  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  27.7 
 
 
211 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  27.23 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0250  putative lipoprotein  30.56 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  27.72 
 
 
203 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>