51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0208 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  76.08 
 
 
208 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  73.21 
 
 
208 aa  291  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  63.94 
 
 
212 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  63.94 
 
 
212 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  63.94 
 
 
212 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  63.94 
 
 
212 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  63.94 
 
 
212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  63.94 
 
 
212 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  63.46 
 
 
212 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  68.51 
 
 
210 aa  246  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  69.32 
 
 
207 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  67.33 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  71.59 
 
 
221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  71.59 
 
 
207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  71.59 
 
 
207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  65.35 
 
 
207 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  68.32 
 
 
207 aa  224  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  42.39 
 
 
208 aa  134  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  41.67 
 
 
221 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  39.64 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  41.61 
 
 
221 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  35.78 
 
 
237 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  39.86 
 
 
215 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  37.7 
 
 
217 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  37.64 
 
 
228 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  41.29 
 
 
227 aa  94.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  34.67 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  35.82 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  36.08 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  37.88 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  36.69 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  36.84 
 
 
221 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  36.84 
 
 
221 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  32.77 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  32.35 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  32.65 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  33.74 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  31.25 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  25.93 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  22.28 
 
 
198 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  29.27 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1202  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.34 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.203134  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  27.75 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  27.18 
 
 
214 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  25.51 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  25 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  25 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  28.65 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  25.38 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0478  hypothetical protein  27.21 
 
 
199 aa  42  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>