20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0478 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  393  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2842  hypothetical protein  46.67 
 
 		 190 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2745  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  37.3 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.13119 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  30.63 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  30.27 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  27.98 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  31.25 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  27.61 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  27.61 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  28.22 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  29.44 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  27.36 
 
 		 209 aa  41.6  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>