19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2745 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2745  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.13119 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2842  hypothetical protein  40.93 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0478  hypothetical protein  35.96 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  29.53 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  31.94 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  31.94 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  28.93 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  24.75 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  25.28 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.48 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.68 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  23.62 
 
 		 378 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  30.97 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  20.77 
 
 		 398 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  31.21 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  29.03 
 
 		 211 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  33.04 
 
 		 198 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 211 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  28.37 
 
 		 228 aa  41.2  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>