52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0296 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  100 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  54.81 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  47.41 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  48.21 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  45.58 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  48.24 
 
 		 224 aa  158  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  49.75 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  47.96 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  50.75 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  39.5 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  38.89 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  42.7 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  42 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  37.5 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  38.31 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  37.02 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  41.84 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  38.14 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  37.7 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  41.58 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.52 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  38.22 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  41.57 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  41.57 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  41.57 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.41 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  38.46 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  32.97 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  31.16 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  31.34 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  31.15 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  31.15 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  31.79 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  30.29 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  28.84 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1525  hypothetical protein  23.91 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00769355  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  25.47 
 
 		 198 aa  48.5  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.66 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  28.07 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  28.12 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1609  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  26.44 
 
 		 192 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  28 
 
 		 211 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  27.36 
 
 		 211 aa  42  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>