42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0171 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0171  putative lipoprotein  100 
 
 
221 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0178  protein of unknown function DUF330  98.19 
 
 
221 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0316  lipoprotein  80.22 
 
 
211 aa  289  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.926331  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0098  lipoprotein  50.27 
 
 
208 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0069  hypothetical protein  48.7 
 
 
215 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4222  hypothetical protein  41.24 
 
 
208 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0494  hypothetical protein  42.11 
 
 
208 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345073  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1364  putative lipoprotein  40.31 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.629099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3198  putative lipoprotein  40.31 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0229  putative lipoprotein  40.31 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0063  putative lipoprotein  40.31 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0453  putative lipoprotein  40.31 
 
 
212 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  40.31 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1984  putative lipoprotein  41.9 
 
 
217 aa  115  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0376  hypothetical protein  40.22 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  39.8 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6240  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  43.21 
 
 
207 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2947  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.7 
 
 
238 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3914  putative lipoprotein  36.41 
 
 
234 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.28345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0406  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  39.09 
 
 
207 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2907  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  42.86 
 
 
221 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2283  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  42.86 
 
 
207 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2898  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  42.86 
 
 
207 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0233  putative lipoprotein  37 
 
 
237 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2809  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  44.44 
 
 
207 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0923  putative lipoprotein  40.1 
 
 
228 aa  94.7  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0208  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2369  putative lipoprotein  34.33 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.727171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0171  putative lipoprotein  37.57 
 
 
172 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0368  putative lipoprotein  39.76 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1209  putative lipoprotein  34.57 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0309  putative lipoprotein  37.82 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0185  putative lipoprotein  35.62 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0296  protein of unknown function DUF330  40.84 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0253  putative lipoprotein  36.89 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0247  protein of unknown function DUF330  36.55 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.661362  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1793  hypothetical protein  31.71 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.593352  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2134  lipoprotein, putative  31.71 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2274  protein of unknown function DUF330  32.63 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0375  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  30.57 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  28.23 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  26.12 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>