154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3670 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  702    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  58.52 
 
 		 357 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  41.35 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  38.71 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  38.71 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  38.44 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  38.42 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  35.16 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  34.72 
 
 		 307 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  32.49 
 
 		 331 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  36.15 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  36.13 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  35.16 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  33.91 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.94 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.94 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  34.2 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  34.9 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  36.33 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  31.44 
 
 		 456 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  32.73 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  30.56 
 
 		 456 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  34.7 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  43.46 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  32.71 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  29.71 
 
 		 306 aa  142  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  27.84 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  26.32 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  29.24 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  36.28 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  26.02 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  29.95 
 
 		 321 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.95 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  39.58 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  29.25 
 
 		 305 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  30.55 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  26.99 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  30.14 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  29.71 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  27.33 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  40.31 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  28.85 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  34.09 
 
 		 398 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  27.83 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  29.15 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  26.78 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  26.21 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  32.73 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  27.55 
 
 		 312 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  31.93 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  31.6 
 
 		 579 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  37.76 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  28.85 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  26.78 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  24.71 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  27.33 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  31.12 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0661  hypothetical protein  30.56 
 
 		 273 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  28.57 
 
 		 315 aa  94  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  25.21 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  28.85 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.85 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  22.81 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  38.28 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.05 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  26.58 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  24.36 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  24.16 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  31.22 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  31.22 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  27.44 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  25.22 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  23.36 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  25.1 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  22.41 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  27.91 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  22.86 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  27.07 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  24.47 
 
 		 316 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  28.72 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.13 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  25.24 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  21.25 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  26.67 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  23.92 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  26.61 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  22.74 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  22.52 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  22.52 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.13 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  23.63 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  23.35 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  27.97 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.37 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  29.37 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  29.37 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>