169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3566 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  622  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  36.91 
 
 
316 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  33.45 
 
 
302 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  32.09 
 
 
308 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  31.02 
 
 
312 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  31.95 
 
 
312 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  30.89 
 
 
312 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  30.89 
 
 
312 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  30.89 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  31.21 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  30.99 
 
 
312 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  32.27 
 
 
307 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  31.63 
 
 
306 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  29.65 
 
 
308 aa  149  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  33.76 
 
 
313 aa  148  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  29.65 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  34.29 
 
 
433 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  32.32 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  30.86 
 
 
321 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.62 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  30.14 
 
 
353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  30.49 
 
 
579 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.27 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.95 
 
 
331 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  31.8 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  30.96 
 
 
308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  29.36 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  29.87 
 
 
321 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.8 
 
 
308 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  29.8 
 
 
308 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  27.33 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  27.85 
 
 
313 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.78 
 
 
275 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  26.38 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  30.08 
 
 
360 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  30.08 
 
 
360 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  29.68 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  29.56 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  27.71 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  27.44 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  29.7 
 
 
360 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  30.74 
 
 
319 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  30.86 
 
 
360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.65 
 
 
292 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  28.16 
 
 
307 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  31.87 
 
 
289 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  26.27 
 
 
313 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  31.58 
 
 
455 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  27.72 
 
 
298 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  32.39 
 
 
317 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  29.32 
 
 
293 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  32.39 
 
 
291 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  29 
 
 
312 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  30.83 
 
 
297 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  28 
 
 
315 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.34 
 
 
296 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.57 
 
 
296 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  27 
 
 
458 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  27.18 
 
 
321 aa  99.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  28.04 
 
 
359 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  26.32 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  27.68 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  25.62 
 
 
325 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  26.59 
 
 
316 aa  96.3  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.85 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  26.75 
 
 
456 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  29.03 
 
 
378 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  24.68 
 
 
456 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  25.71 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  26.69 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.77 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  25.62 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.77 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.77 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.77 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.77 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.77 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.77 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.35 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  26.42 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  27.36 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.33 
 
 
309 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  26.37 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  28.15 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  26.73 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  26.5 
 
 
322 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  25.53 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  33.85 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  26.69 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  26.69 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  31.61 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  26.69 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  26.69 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  26.69 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  23.75 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  40.52 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  39.66 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  25.24 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  31.65 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  32.75 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>