143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1895 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  100 
 
 		 455 aa  900    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  65.79 
 
 		 456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  65.13 
 
 		 456 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  58.77 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  44.1 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.34 
 
 		 331 aa  199  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  44.49 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  43.5 
 
 		 331 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  36.33 
 
 		 353 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  28.39 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  28.13 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  27.37 
 
 		 360 aa  153  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  28.51 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  25.61 
 
 		 360 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  25.98 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  26.21 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  36.4 
 
 		 293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  37.76 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  33.98 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  34.17 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  32.47 
 
 		 297 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  35.27 
 
 		 289 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  29.23 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  34.09 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.63 
 
 		 292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  29.18 
 
 		 307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  28.4 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  31.4 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  28.57 
 
 		 308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  25.05 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  31.47 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  29.15 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  28.88 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  31.14 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.15 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  28.82 
 
 		 312 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  31 
 
 		 313 aa  107  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  31.55 
 
 		 398 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  31.44 
 
 		 312 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  31.58 
 
 		 312 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.67 
 
 		 579 aa  106  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  32.11 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  33.82 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  30.89 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  31.58 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  30.73 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.07 
 
 		 296 aa  99.4  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  30.53 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  31.91 
 
 		 313 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  33 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  24.91 
 
 		 305 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.78 
 
 		 296 aa  97.1  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.92 
 
 		 296 aa  96.7  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  26.63 
 
 		 316 aa  95.9  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  26.5 
 
 		 312 aa  95.5  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  24 
 
 		 308 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24 
 
 		 308 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  30 
 
 		 334 aa  94  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  31.55 
 
 		 378 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  29.41 
 
 		 307 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  28.92 
 
 		 307 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  40.52 
 
 		 316 aa  87  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  26.78 
 
 		 313 aa  87  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  25.87 
 
 		 312 aa  86.7  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  27.81 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  26.97 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  27.35 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  28.25 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  26.05 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.06 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  26.71 
 
 		 320 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  27.16 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  29.56 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  21.37 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  24.85 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  27.9 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  27.2 
 
 		 330 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  27.9 
 
 		 310 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.98 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  26.23 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  27.54 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  27.54 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  27.54 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  27.56 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  37.01 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  26.29 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  33.9 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  24.45 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  32.74 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.05 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.05 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.05 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.05 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.05 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.05 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.05 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  24.86 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>