138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6241 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
309 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  97.41 
 
 
309 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  97.41 
 
 
309 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  97.73 
 
 
309 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  92.83 
 
 
310 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  92.83 
 
 
311 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  91.59 
 
 
309 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 
309 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 
309 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 
309 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 
309 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 
309 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 
309 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 
309 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  72.82 
 
 
309 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  62.81 
 
 
320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  63.44 
 
 
320 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  62.81 
 
 
320 aa  352  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  42.95 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  42.77 
 
 
322 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  41.07 
 
 
330 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  42.01 
 
 
322 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  41.22 
 
 
313 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  39.69 
 
 
323 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  36.53 
 
 
325 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  36.53 
 
 
325 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  37 
 
 
321 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  35.74 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  38.19 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  33.88 
 
 
310 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  32.59 
 
 
320 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  33.88 
 
 
310 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  35.14 
 
 
326 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  32.32 
 
 
316 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  30.38 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  30.38 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  35.51 
 
 
321 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  30.42 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  26.56 
 
 
334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.23 
 
 
331 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  28.38 
 
 
305 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  28.39 
 
 
310 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 
331 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  27.69 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  26.81 
 
 
298 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  23.64 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  28.76 
 
 
313 aa  89.7  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  23 
 
 
307 aa  89.4  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  27.82 
 
 
305 aa  89  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  27.33 
 
 
312 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.67 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.15 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.15 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  22.15 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  27.05 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  26.84 
 
 
312 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  26.28 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.61 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  26.32 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.01 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  24.19 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  25.88 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  21.5 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  33.79 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  25.49 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  24.27 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  30.54 
 
 
433 aa  72.4  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  27.17 
 
 
455 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  23.23 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  35.61 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.93 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.93 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  24.37 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  25.64 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  34.85 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  35.09 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.67 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  22.8 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  26.67 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  26.2 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.41 
 
 
579 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  23.84 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  23.84 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  24.28 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  34.43 
 
 
367 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  27.89 
 
 
295 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  26.4 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  26.09 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  25.11 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  23.53 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  25.11 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  29.37 
 
 
353 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  23.88 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  23.65 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  31.09 
 
 
458 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  31.93 
 
 
456 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  22.26 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  25.35 
 
 
458 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  31.93 
 
 
456 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>