192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2048 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1112    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  38.32 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  41.28 
 
 		 321 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.63 
 
 		 321 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  38.63 
 
 		 321 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  35.71 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  33.59 
 
 		 302 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  35.22 
 
 		 307 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  32.25 
 
 		 312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  38.62 
 
 		 312 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  38.62 
 
 		 312 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  30.49 
 
 		 312 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  38.1 
 
 		 312 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  30.41 
 
 		 312 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  30.69 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  30 
 
 		 312 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  29.81 
 
 		 313 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  40.94 
 
 		 316 aa  121  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  29.22 
 
 		 308 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  34.04 
 
 		 312 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  28.12 
 
 		 308 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  31.84 
 
 		 308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  31.6 
 
 		 353 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  28.62 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  30.18 
 
 		 360 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  30.06 
 
 		 313 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  29.23 
 
 		 360 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  30.18 
 
 		 360 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  30.43 
 
 		 360 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  31.17 
 
 		 357 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  32 
 
 		 307 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  25.67 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.86 
 
 		 296 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  35.14 
 
 		 313 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  35.14 
 
 		 308 aa  102  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.86 
 
 		 296 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.75 
 
 		 308 aa  101  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  25.75 
 
 		 308 aa  101  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 		 275 aa  101  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.5 
 
 		 296 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  25.68 
 
 		 458 aa  97.8  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  27.57 
 
 		 316 aa  97.1  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.53 
 
 		 331 aa  95.9  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  28.72 
 
 		 331 aa  94.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  26.67 
 
 		 312 aa  94.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  31.13 
 
 		 319 aa  94.4  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  27.65 
 
 		 304 aa  94  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.58 
 
 		 292 aa  93.6  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  25.8 
 
 		 313 aa  93.6  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  28.15 
 
 		 315 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  23.65 
 
 		 288 aa  92  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.77 
 
 		 331 aa  90.9  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  29.07 
 
 		 313 aa  90.1  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  32.63 
 
 		 308 aa  88.6  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  28.28 
 
 		 313 aa  88.6  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  25.26 
 
 		 313 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  29.01 
 
 		 310 aa  88.6  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  28.15 
 
 		 289 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  28.34 
 
 		 330 aa  87  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  26.76 
 
 		 334 aa  86.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  24.09 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  23.1 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  28.94 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  28.22 
 
 		 297 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  28.63 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  29.46 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  25.67 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  25.42 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  30.62 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  22.35 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  31.72 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  22.36 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  26.48 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  25.97 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  30.81 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  26.48 
 
 		 325 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  32.77 
 
 		 367 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  23.14 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  25.47 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  25.82 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  27.57 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.36 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  24.84 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  25.52 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  25.91 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  26.41 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  26.89 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  26.41 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  30 
 
 		 369 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  27.42 
 
 		 320 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.97 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  36.03 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  30.89 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  30.89 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.34 
 
 		 309 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  25.08 
 
 		 315 aa  72  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.34 
 
 		 309 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.34 
 
 		 309 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.34 
 
 		 309 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>