185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1718 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  634    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  91.28 
 
 
321 aa  584  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  90.97 
 
 
321 aa  584  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  41.28 
 
 
579 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  35.2 
 
 
307 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  36.72 
 
 
433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  35.62 
 
 
306 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  32.63 
 
 
308 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  32.23 
 
 
302 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  32.19 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  30.37 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  30.15 
 
 
312 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  30.3 
 
 
308 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  29.54 
 
 
312 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  30 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  28.96 
 
 
312 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  29.5 
 
 
312 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  28.49 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.28 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  29.05 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.03 
 
 
331 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  29.87 
 
 
312 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  29.94 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  28.85 
 
 
353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  29.05 
 
 
312 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  28.7 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  30.37 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  30.47 
 
 
357 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  27.41 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  28.75 
 
 
313 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  38.89 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  28.22 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  29.4 
 
 
360 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  27.66 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  28.13 
 
 
360 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.54 
 
 
275 aa  109  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  29.08 
 
 
315 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  28.88 
 
 
455 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  36.51 
 
 
360 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  36.51 
 
 
360 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  33.21 
 
 
319 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.57 
 
 
296 aa  106  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30 
 
 
296 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.91 
 
 
308 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  26.91 
 
 
308 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.78 
 
 
292 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  28.04 
 
 
307 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.62 
 
 
296 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  27.84 
 
 
308 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  28.04 
 
 
307 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  27.36 
 
 
297 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  25.87 
 
 
291 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  29.23 
 
 
313 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  26.79 
 
 
289 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  27.08 
 
 
359 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  26.88 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  26.81 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  25.93 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  25.48 
 
 
456 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  23.84 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  25.16 
 
 
456 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  24.72 
 
 
458 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  24.77 
 
 
334 aa  92.8  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  26.61 
 
 
313 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  29.94 
 
 
298 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  43.1 
 
 
390 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  30.99 
 
 
369 aa  87  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  37.04 
 
 
378 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  32.74 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  42.24 
 
 
390 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  40.52 
 
 
398 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  40.52 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  26.79 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  25.91 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  25.71 
 
 
458 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  30.54 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  27.44 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  34.03 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  20.89 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  24.55 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  30.37 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  30.37 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  21.75 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  25.91 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  26.22 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  23.89 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  27.38 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  27.34 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  29.13 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  26.54 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  32.38 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  23.51 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  25.39 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  22.4 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  23.78 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09330  virulence factor Mce family protein  30.74 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  24.74 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.29 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.29 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>