154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1454 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  80 
 
 		 297 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  78.02 
 
 		 291 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  72.67 
 
 		 317 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  71.86 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  74.54 
 
 		 292 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0661  hypothetical protein  40.97 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  34.2 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  36.42 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  32.47 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  32.47 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 360 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  31.61 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  32.09 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  31.55 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  45.26 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  42.93 
 
 		 367 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  42.11 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  39.47 
 
 		 378 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  38.34 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  30.43 
 
 		 331 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  38.34 
 
 		 390 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  37.82 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  30.23 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  30.59 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  29.57 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.34 
 
 		 331 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.34 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  35.27 
 
 		 455 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  27.52 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  29.24 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  27.18 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  28.99 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  28.05 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.04 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  25.93 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  29.5 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  28.35 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  29.02 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  33.83 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  27.73 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  29.18 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  29.18 
 
 		 456 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  30.86 
 
 		 458 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  29.03 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  28.05 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  29.03 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  27.24 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  30.9 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  25.99 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  29.65 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.65 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  27.6 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  26.79 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  28.09 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.44 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  29.81 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  29 
 
 		 307 aa  95.5  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  30 
 
 		 313 aa  95.5  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  25.15 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  27.33 
 
 		 433 aa  92.8  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  27.71 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  27.84 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  25.91 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  28.15 
 
 		 579 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  27.5 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  29.03 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.92 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  24.75 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  21.84 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.52 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.57 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  24.35 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  31.79 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.22 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.03 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.03 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.03 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.03 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.03 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.03 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.03 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  23.87 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  23.81 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  25.89 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  26.39 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  24.92 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.68 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  23.33 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  23.33 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  24.5 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  24.5 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  24.5 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  31.03 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  21.93 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  30.6 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  22.05 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  22.92 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  23.11 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.86 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>