139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5555 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  100 
 
 		 292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  76.38 
 
 		 291 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  75.93 
 
 		 297 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  74.54 
 
 		 289 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  72.51 
 
 		 317 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  72.79 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0661  hypothetical protein  41.1 
 
 		 273 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  34.46 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  35.16 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 360 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  37.54 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  44.95 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  44.95 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  34.46 
 
 		 359 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  42.72 
 
 		 378 aa  158  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  33.33 
 
 		 359 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  31.92 
 
 		 360 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  41.96 
 
 		 367 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  40.2 
 
 		 398 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  39.8 
 
 		 390 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  31.71 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  39.3 
 
 		 390 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  33.05 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  31.46 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.4 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.4 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  30.9 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  32.86 
 
 		 456 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  32.52 
 
 		 458 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  31.07 
 
 		 456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  34.09 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  31.56 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  35.64 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  29.3 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  32.42 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  32.65 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.86 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  28 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  29.7 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  30.07 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  26.26 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  29.32 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  34.87 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  27.42 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  31.84 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  28.99 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  27.78 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  32.82 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  28.33 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  27.81 
 
 		 433 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  26.64 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  34.57 
 
 		 312 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  29.13 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.13 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  30.2 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  28.11 
 
 		 316 aa  95.5  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  29.1 
 
 		 579 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.79 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  26.67 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  28.08 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  26.09 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  30.38 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  28.08 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  27.99 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  25.76 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.5 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  24.7 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  31.19 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.37 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  31.66 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.03 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.93 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  24.9 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  26.67 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  25.38 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  24.76 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  25.52 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  24.76 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  23.93 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  25.55 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.82 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.67 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  24.68 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  24.68 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  31.62 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  25.5 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  23.69 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  22.41 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  30.05 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  33.06 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  22.26 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>